犬皮肤肥大细胞肿瘤双核和多核肿瘤数据集

作者: | Christof A. Bertram | Taryn A. Donovan | Marco Tecilla | Florian Bartenschlager | Marco Fragoso | Frauke Wilm | Christian Marzahl | Katharina Breininger | Andreas Maier | Robert Klopfleisch | Marc Aubreville |

摘要:具有双核细胞(双核细胞,BINC)或更多细胞核的肿瘤细胞(多核细胞,MUNC)表明细胞遗传物质的数量增加,被认为有助于肿瘤的发生、发展和治疗抵抗。在犬皮肤肥大细胞肿瘤(CcMCT)中,双核和多核是细胞学和组织学分级方案中使用的参数,与患者预后不良有关。在这项研究中,我们创建了第一个开放源码数据集,其中包含19,983个binc注释和1,416个MUNC注释,涉及32张ccMCT的组织学完整图像。标签是由病理学家和算法辅助标记方法创建的,并对每个产生的候选人进行专家评审。一种先进的基于深度学习的模型在11张幻灯片图像上的F1评分为0.675分,MUNC评分为0.623分。在从这些测试图像中提取的感兴趣区域(2.37mm2)中,6位病理学家的目标检测性能在0.270-0之间。BINC为526分,MUNC为0.316~0.622分,而我们的模型为:BINC为0.667分,MUNC为0.685分。这个开放的数据集可以促进这一任务的自动图像分析的发展,从而有助于促进组织学肿瘤预测的这个方面的标准化。

论文地址

https://arxiv.org/abs/2101.01445v1

下载地址

https://arxiv.org/pdf/2101.01445v1.pdf

全部源码

https://github.com/DeepPathology/CCMCT_Bi_Multinucleated

目标检测整体幻灯片图像

相关推荐

暂无评论

微信扫一扫,分享到朋友圈

犬皮肤肥大细胞肿瘤双核和多核肿瘤数据集